Reakce více zemí na klastr hantavirů v Andách: NAAT a sekvenování celého genomu jako klíčové nástroje

V dubnu 2026 vyplula polární expediční výletní loď pod nizozemskou vlajkouMS Hondiusodletěl z Ushuaii v Argentině. Dne 6. dubna se u jednoho z cestujících objevila horečka a bolesti hlavy, na které o pět dní později zemřel. Jeho manželka také onemocněla a zemřela po převozu do Jihoafrické republiky. Následně byl u 69letého britského cestujícího pozitivní test na hantavirus a zůstává na jednotce intenzivní péče. K 13. květnu Světová zdravotnická organizace uvedla, že11 případů a 3 úmrtísouvisející s vypuknutím nákazy na lodi.

I. Přehled virů a patogenní typy

Hantaviry jsou skupinou RNA virů přenášených převážně hlodavci, patřících do rodu Orthohantavirus z čeledi Bunyaviridae. Jejich genom se skládá ztři segmenty (L, M a S), kódující RNA-dependentní RNA polymerázu, glykoproteiny a nukleokapsidový protein. Na základě geografického rozšíření a klinických projevů se hantaviry dělí nadvě hlavní skupiny:

Hantaviry Starého světa(vyskytuje se v Evropě, Asii a Africe) způsobujeHemoragická horečka s renálním syndromem (HFRS)Mezi reprezentativní viry patří virus Hantaan (HTNV), virus Seoul (SEOV) a virus Puumala (PUUV). Primárně útočí na ledviny, což vede k jejich poškození, hemoragickým projevům a v závažných případech k šoku. Míra úmrtnosti se liší podle typu viru, ale obecně se pohybuje od<1 % až 5–15 %.

Hantaviry Nového světa(cirkulující v Severní a Jižní Americe) způsobujeHantavirový plicní syndrom (HPS)Mezi reprezentativní viry patří virus Sin Nombre (SNV) a virus Andes (ANDV). Primárně napadají plíce a způsobují rychle se rozvíjející nekardiogenní plicní edém, těžké respirační potíže a kardiovaskulární komplikace. Počáteční příznaky jsou podobné chřipce (horečka, bolesti svalů, gastrointestinální potíže), ale onemocnění může rychle vést k respiračnímu selhání s...úmrtnost dosahující 30–50 %.

Propuknutí nákazy na výletních lodích bylo způsobeno hlavněAndský virus (ANDV), který patří kHantavirový plicní syndrom (HPS)podtyp.

II. Tradiční hantaviry asociované s HFRS vs. virus Andes (HPS)

Tradiční vysokofrekvenční sycený chlazený systém (HFRS)

III. Způsoby přenosu

Hantavirus se přenáší hlavně prostřednictvímpřímý kontakt s výkaly, slinami nebo močí infikovaných hlodavcůnebovdechování aerosolových výkalůMezi další možné trasy patří:

- Pokousání nebo poškrábání nakaženými hlodavci;

- Konzumace jídla kontaminovaného močí, trusem nebo slinami infikovaného hlodavce;

- Dotýkání se očí, nosu nebo úst po kontaktu s kontaminovanými předměty.

Přenos z člověka na člověka je extrémně vzácný, ale bylo potvrzeno proAndský virus (ANDV).

IV. Globální trasování kontaktů s hantavirem – testování a sekvenování nukleových kyselin jako klíčové technologie

Po vypuknutí nákazy virem ANDV zahájily zdravotnické orgány ve více než deseti zemích – včetně Španělska, Spojeného království, Spojených států, Kanady a Švýcarska – současně sledování kontaktů a monitorování karantény. Francie, Spojené státy a další země nadále sledují zdravotní stav svých občanů, kteří se vrátili ze zasažené lodi.

V rámci této reakce na mimořádnou událost v rámci více zemí,testování nukleových kyselin a genomové sekvenovánísehráli nepostradatelnou klíčovou roli:

-Testování nukleových kyselinposkytuje definitivní důkazy pro rychlou identifikaci patogenů;

-Genomické sekvenovánínabízí nenahraditelné molekulární důkazy pro sledování zdroje infekce, potvrzení přenosových řetězců a posouzení virových změn.

V. Detekční roztoky pro hantaviry (zejména typu HPS)

1. Včasná identifikace patogenu

1.1 Testování v místě péče (POCT)
Přesný screening a testování v nouzových situacích –od vzorku k výsledku za 1 hodinu.
Diagnostické výzvy a rychlá molekulární řešení Testování v místě péče
1.2 Konvenční PCR
Konvenční PCR

2. Sekvenční řešení

Pro identifikaci patogenů a sledování ohnisek v případechhorečka neznámého původu, respirační potíže nebo hemoragické projevy.
hemoragické projevy

Základní vlastnosti:

Základní funkce

VI. Ověřené údaje o výkonu

Dosaženo sekvenování celého genomu vzorků pozitivních na hantavirus založené na zachycení sondy>99% pokrytí genomu v hloubce 30×.
Ověřené údaje o výkonu

Genotypizace hantavirů a analýza poměru podtypů na bázi odpadních vod je proveditelná.
podíl podtypů

VII. Související stavebnice

Související sady


Čas zveřejnění: 14. května 2026