Lidský methylovaný gen NDRG4/SEPT9/SFRP2/BMP3/SDC2

U dospělých více než 108 střevních epiteliálních buněk každý den odpadne ze střevní stěny a jsou vylučovány stolicí peristaltikou tlustého střeva.Vzhledem k tomu, že nádorové buňky pravděpodobněji odpadnou ze střevního traktu při abnormální proliferaci, stolice pacientů s nádorem střeva obsahuje mnoho nemocných buněk a abnormálních buněčných složek, což je materiálový základ pro stabilní detekci stolice.Studie zjistily, že methylační modifikace genových promotorů je časnou událostí v tumorigenezi a genetický materiál získaný ze vzorků stolice pacientů s kolorektálním karcinomem může odrážet přítomnost rakoviny ve střevě dříve.

NDRG4, také známý jako SMAP-8 a BDM1, je jedním ze čtyř členů rodiny genů NDRG (NDRG1-4), u nichž bylo prokázáno, že souvisí s buněčnou proliferací, diferenciací, vývojem a stresem.Je ověřeno, že methylace NDRG4 je potenciálním biomarkerem pro neinvazivní detekci kolorektálního karcinomu ve vzorcích stolice.

SEPT9 je členem rodiny genů Septin, která se skládá z alespoň 13 genů, které kódují konzervovanou doménu GTPázy, která může vázat proteiny související s cytoskeletem, a je spojena s dělením buněk a tumorigenezí.Studie zjistily, že obsah methylovaného genu Septin9 je charakteristicky zvýšený ve vzorcích stolice pacientů s kolorektálním karcinomem.

Secernované proteiny související s frizzled (sFRPs) jsou rozpustné proteiny, které jsou třídou antagonistů Wnt dráhy díky jejich vysoké strukturální homologii s receptorem frizzled (Fz) pro Wnt signalizaci.Inaktivace genu SFRP vede k nekontrolované aktivaci Wnt signalizace spojené s kolorektálním karcinomem.V současné době lze metylaci SFRP2 ve stolici použít jako neinvazivní biomarker pro diagnostiku kolorektálního karcinomu.

BMP3 je členem superrodiny TGF-B, a proto hraje důležitou roli v embryonálním vývoji tím, že indukuje a formuje ranou tvorbu kosti.BMP3 je hypermethylovaný u kolorektálního karcinomu a může být použit jako důležitý nádorový marker.

SDC2 je buněčný povrchový heparansulfátový proteoglykan zapojený do regulace mnoha fyziologických a patologických procesů.Fyzikální zpracování zahrnuje buněčnou proliferaci, diferenciaci, adhezi, organizaci cytoskeletu, migraci, hojení ran, komunikaci mezi buňkami a matricí, angiogenezi;Mezi patologické procesy patří zánět a rakovina.Úroveň methylace genu SDC2 ve tkáních kolorektálního karcinomu byla významně vyšší než v normálních tkáních.